在初步审查或者实质审查程序中，审查员发现申请存在明显性缺陷、格式缺陷、或者实质性缺陷时，应用补正通知书或者审查意见书的形式，通知申请人在指定的时间内对申请进行补正、修改或者对审查员指出的缺陷陈述意见。申请人对此必须答复，无正当理由不答复的，申请将被视为撤回。申请人答复时应当注意以下各点：
(1)遵守答复期限，逾期答复和不答复后果是一样的。
针对审查意见通知书指出的问题，分类逐条答复。答复可以表示同意审查员的意见，按照审查意见办理补正或者对申请进行修改;不同意审查员意见的，应陈述意见及理由。
(2)属于格式或者手续方面的缺陷，一般可以通过补正消除缺陷;明显实质性缺陷一般难以通过补正或者修改消除，多数情况下只能就是否存在或属于明显实质性缺陷进行申辩和陈述意见。
(3)对发明或者实用新型专利申请的补正或者修改均不得超出原说明书和权利要求书记载的范围，对外观设计专利申请的修改不得超出原图片或者照片表示的范围。修改文件应当按照规定格式提交替换页。
(4)答复应当按照规定的格式提交文件。如提交补正书或意见陈述书。一般补正形式问题或手续方面的问题使用补正书，修改申请的实质内容使用意见陈述书，申请人不同意审查员意见，进行申辩时使用意见陈述书。
